Главная / Вокруг нас / Мыши вместо людей: приключения исследователей ДНК

Мыши вместо людей: приключения исследователей ДНК

Начиная с девятого века и продолжая большую часть эпохи викингов, большая часть того, что сейчас находится в Англии, находится под ДэнЛо: «Датское право», т.е. датских викингов.

Даже сегодня Колби, Сейктон и десятки других английских деревень имеют названия мест, взятых из древнескандинавских. В 2015 году в Природе исследователи опубликовали результаты проекта People of the British Isles (PoBI), который стремился сопоставить генетический состав современного населения в беспрецедентном масштабе.

В рамках проекта были собраны генетические образцы из более чем 2000 человек, проживающих в тех же сельских районах, что и их дедушки и бабушки называли домом. Идея состояла в том, чтобы собрать ДНК из географически стабильных популяций, чтобы найти кластеры генетических сходств, которые предшествовали миру после индустриальной революции повышенной мобильности. И команда нашла 17 из этих кластеров. Большинство выводов из бумаги были неудивительными, но один стал громоотводом: не было очевидных генетических свидетельств датской оккупации, предполагая «относительно ограниченное» влияние датского викингов.

Для многих археологов и историков открытие, похоже, испортило их обширное исследование, документирующее значительное и долгосрочное присутствие датского викингов в районе ДэнЛо и за его пределами.

В конце 2016 года генетик из Бергенского университета Берген (Røyrvik), один из авторов исследования природы в 2015 году, сделал необычный шаг в публикации другой интерпретации своей собственной статьи. «Когда вы пишете бумагу с 15 разными людьми, не каждая перспектива может быть включена», — говорит Рёйрвик. Реакция, опубликованная в Древности и соавторство с археологом Оксфордского университета Джейн Кершоу, предложила «альтернативную интерпретацию» данных ПоБИ в отношении датских викингов — та, которая объединяет археологические данные, а также исторические и лингвистические подсказки.

Например, Кершоу и Рёйрвик отметили десятки брошек эпохи викингов, обнаруженных в сельской Англии. Эти броши были больше, чем семейные реликвии или связанные с статусом ювелирные изделия: они были основными потребностями гардероба, которые каждый день носили, чтобы у женщины не было наружного, фарфорового платья. Количество найденных брошей указывает на целые семьи, а не только на оккупационные силы, присутствующие на всей территории. Рёйрвик подчеркивает, что она стоит на основной бумаге природы. «Исходя из того, что одно предложение неверно, это не значит, что вся бумага неверна», — говорит она.

Рассказ о выводах, сделанных в документе о датском влиянии на 2015 год, дает предостерегающую историю о том, как основанные на ДНК исследования исторических популяций могут пойти наперекосяк. Проблема началась, когда исследователи искали небританские популяции, чтобы сравнить их образцы. «Мы собрали очень много образцов из британского народа, — говорит Рёйрвик. «Довольно поздно, было проведено сравнение с европейским населением. Мы пытались получить финансирование, но ЕС не пошел на это». Без финансовой поддержки Европейского союза команда собрала данные предыдущих исследований, некоторые из них с совершенно другим фокусом. Например, датские генетические подписи были получены из ДНК пациентов с рассеянным склерозом в больнице в Копенгагене, которая участвовала в более раннем исследовании МС. Не было никакого генетического материала из контрольной популяции здоровых датчан, и не было никакой информации о родных городах пациентов.

«Это было не идеально. Это была конечная точка множества разных процессов », — говорит Рёйрвик. Отсутствие тщательно продуманной современной датской ДНК означало, что датская генетическая подпись не была так четко определена, как это было бы, если бы исследователи опросили население Дании с той же методологией, которую они использовали для участников в Британии. Это может показаться расщеплением волос, но без четкого датского сигнала было гораздо сложнее отделить образцы датского викинга от других жителей северной Европы, присутствующих в Великобритании: всего за несколько сотен лет до викингов англосаксы из северной Германии приземлился в Англии, и многие поселились.

«Существует перекрытие географии, и они также очень близки по времени», — говорит Рёйрвик о двух северных европейских группах. Она считает, что генетические подписи, которые интерпретируются как англосаксон в газете Nature, возможно, были, по крайней мере, частично от датских викингов. «С любой научной статьей вы надеетесь, что данные верны, и наша была отличной. Вы надеетесь, что анализ данных верен, и я считаю, что наш был. Это толкование, — говорит Рёйрвик. Самые мелкие викинги. Разгадывая геномы викингов и их потомков, он делает заголовки, более скромный источник ДНК предоставляет некоторые из самых интригующих подсказок для их утраченной истории. Просто спросите Джереми Сирла из Корнеллского университета, эволюционного биолога, чья команда использует мелких млекопитающих — особенно мышей — для отслеживания исторического движения человека. Потому что особенно сложно получить ДНК-генетическую ДНК мыши в маленьких костях, которая ухудшается быстрее, чем у более крупных животных, и их часто недостаточно, чтобы попробовать (Сирл и его команда сравнивают ДНК с современными, географически разнообразными мышами. Большая часть их работы сосредоточена на домашней мыши (Mus musculus), которая превратилась в комменсацию с людьми: мыши не одомашнены, как собаки или овцы, но они зависят от жизни в человеческом поселении и вокруг него).

Исследование викингов Сирлом началось с потрясающего открытия более десяти лет назад, помогая студенту проанализировать ДНК мыши с португальского острова Мадейра, находящегося на расстоянии более 400 миль от побережья Марокко. Первоначально Сирл сравнивал генетические подписи образца Мадейры с другой ДНК-мышью вручную, медленным и кропотливым процессом, который с тех пор был в значительной степени заменен компьютерными программами. «Я ожидал, что мыши Мадейры будет соответствовать последовательностям из Португалии — Мадейра была обнаружена португальцами, колонизированными португальцами, а основная часть движения через порты была с Португалией», — говорит Сирл. «Когда я сравнивал последовательности на глаз, они вообще не связывались с Иберией, но были идентичны Северной Европе». Дальнейший анализ, в том числе старое секвенирование ДНК, опубликованное второй командой в 2014 году, подтвердило прочную связь в генетической подписи мышей Мадейры с мышами, которые жили среди датских возрастов викингов. Хотя на Мадейре нет археологических или исторических данных о высадке викингов, Сирл полагает, что один из их кораблей, возможно, свернул с курса, и он оказался на отдаленном острове Атлантики. Викингах на острове было, по-видимому, непродолжительным, достаточно долго, чтобы несколько бездомных грызунов могли взять отпуск на берег, который оказался постоянным.

Аналогичное исследование показало, что могут быть генетические подписи норвежских мышей эпохи викингов в современных популяциях на Азорских островах, цепочке островов, более чем в 900 милях к западу от Португалии. Мыши, говорит Сирл, делают особенно хорошие суррогаты или биопроксипы для человеческого движения. «Помимо людей и некоторых прислужников, которые люди принесли с собой, мыши являются наиболее распространенными в мире млекопитающими», — говорит он. «Они быстро размножаются и могут попасть на транспортные средства и лодки. И когда вы пытаетесь понять человеческую историю и движение, вы говорите о лодках и караванах ». Несмотря на случайные непреднамеренные глобальные автостопы, мыши являются относительными домашними животными. Они, как правило, остаются на территории нескольких сотен футов, поэтому они вряд ли будут колонизировать новые районы, если человеческое движение не приведет их туда. «Мышей случайно сбросили, оставив, как глиняный осколок», — говорит Сирл. «Но в отличие от глиняного осколка эти живые артефакты имеют ДНК, которая представляет собой экстраординарную энциклопедию информации, которую вы теперь можете использовать очень сложным образом». И использование мышей в качестве биопрокситов может рассказать нам не только о том, где путешествовали викинги, но и о том, как многие из них занимали место.

По мнению Сирла: «Там, где у вас больше людей, у вас, скорее всего, будет больше мышей».

Исследовательский биолог Viking Cods University of Oslo Санни Боссенкул и ее коллега-ботаник Аннилинн Кул три года изучают вопрос, который анализирует исследования Сирла в другом аспекте. «Мы не используем растения и животных, чтобы выяснить, куда пошли викинги, — говорит Боссенкул. «Мы используем, где викинги пошли, чтобы узнать, что они сделали с растениями и животными». В начале своего многолетнего проекта Кул и Боссенкул планировали основывать свое исследование исключительно на образцах ДНК древней флоры и фауны из музейных коллекций и некоторые свежие раскопки. Но вся древняя ДНК подвержена деградации и загрязнению как микробов в окружающей среде, так и современной обработки человеком, а древняя ДНК растений еще более хрупка. «Мы задавались вопросом, собираемся ли мы получить ДНК» — вспоминает Боссенкул. «Ответ был нет». Вместо того, чтобы вообще отказаться от проекта флоры викингов, Кул теперь работает с лингвистами, чтобы использовать названия растений как своего рода заменители ДНК для отслеживания распространения их использования и того, как это использование эволюционировало. Их работа над древней ДНК лошадей эпохи викингов более перспективна: Кул и Боссенкуол собрали около 100 образцов в разных состояниях сохранения, из которых они надеются построить подробную картину того, как перемещаются и меняются животные лошадей. «Мы понятия не имеем, какую историю расскажут, но у нас будет хороший набор данных, чтобы рассказать об этом», — говорит Боссенкуол.

Биолог Бастиаан из Университета Осло полагался на древнюю ДНК от другого животного, чтобы нарисовать изобретательность викингов в исследовании PNAS 2017 года. Благодаря генетическому материалу, сохранившемуся в костях рыбы с археологических объектов, Звезда и его коллеги обнаружили очевидное происхождение торгового маршрута, который продолжается и сегодня. Исследование команды показало, что сначала викинги поймали треску в арктических водах у о-ва Лофотенских островов, климат которой позволяет сохранить за счет сушки на воздухе, а не дороже соления. После сохранения рыбы затем отправляли на юг для потребления в Германии и в других местах. «Викинги были очень умны в своем окружении, — говорит Стар. «Они отправились на Лофотенские острова, потому что знали, что есть массивная треска, и они могут высушить рыбу без соли, делая ее чрезвычайно дешевым белком. Они использовали свою среду для максимального потенциала. «Вперед! Помимо случайной академической стычки и неудач из-за деградации ДНК, исследования геномического век Викинг-эпохи набирают обороты и, по-видимому, включают больший вклад от других дисциплин. «Мы можем упорядочить ДНК, но, не зная историй, контекста, это бессмысленно», — говорит Боссенкул. Она отмечает, что, несмотря на популярный образ объективной точности ДНК, данные часто требуют интерпретации, основанной на предположениях исследователя. «Иногда сигналы очень ясны, но иногда это не так». Она добавляет: «Генетики публикуют данные ДНК, но слишком часто они фактически не слушают то, что говорят археологи. Мы это прекрасно знаем и стараемся не быть таким. Но мы тоже биологи. Мы из разных миров археологи и говорим на другом языке ».

Нынешнее тело ДНК-исследований по викингам — это лишь кончик копья. Аппсальский археолог Цена — это два года в десятилетний проект стоимостью 6 миллионов долларов, чтобы выявить экономические, социальные и экологические факторы, которые привели к эпохе викингов. Палеогенетик Эске Уиллерслев, который получил известность за использование древней ДНК, чтобы пересмотреть наше понимание первых американцев, работает над отдельным проектом с участием генетического материала с эпохи викингов. Команда Уиллерслева отказалась комментировать впереди любой опубликованной работы, но среди ожидаемых ранних результатов: исследование ДНК нескольких мужчин, найденных в двух скандинавских лодках на эстонском побережье, было основано на ДНК. Лодки, раскопанные между 2008 и 2012 годами, были датированы серединой восьмого века и относятся к эпохе позднего Венделя, предшественнику эпохи викингов. Начальник раскопок и археолог Таллиннского университета Юри Питс надеются, что ДНК определит родство между мужчинами, что может дать еще один ключ к тому, как развивается эпоха викингов.

Читать еще:

Одажды писатель Бунин привел в дом при живой жене молодую девушку. И сказал,—

— Она будет с нами жить. Я устал сам писать, это моя секретарша. И жене …

Добавить комментарий